La teoría del arca de noe amazónico postula que, durante el período Pleistoceno, ocurrieron grandes cambios en la cobertura vegetal y la distribución de las especies de plantas y animales. Esto obedeció a cambios climáticos durante los pleni e interglaciares, cambios que se pueden remontar hasta el Mioceno, y que desencadenaron diversos mecanismos de especiación y diversificación de las especies. Las áreas de los biomas se reducían de manera amplia y alternativa según las condiciones climáticas –secas o húmedas– que imperaban. (Haffer, 1982, Prance, 1982, Hernández, 1992).